يسعى المؤتمر إلى تحقيق جملة من الأهداف العلمية والمعرفية والتطبيقية، من أبرزها:

1. توثيق وتحليل تجربة دولة الإمارات في تطوير الاقتصاد الإسلامي.

2. إبراز الدور الإماراتي في تطوير صناعة المالية الإسلامية عالميًا.

3. دراسة الأطر التشريعية والتنظيمية الداعمة للاقتصاد الإسلامي في الدولة.

4. تسليط الضوء على المبادرات الوطنية في مجالات الوقف والزكاة.

5. مناقشة دور الجامعات ومراكز البحث العلمي في دعم الاقتصاد الإسلامي.

6. استشراف مستقبل الابتكار والتقنيات المالية الحديثة في الاقتصاد الإسلامي.

7. تعزيز التعاون بين المؤسسات الأكاديمية والجهات الحكومية والقطاع المالي الإسلامي.

8. بناء منصة دولية للحوار العلمي حول التجربة الإماراتية ونقلها إلى الدول الأخرى.

9. إصدار توصيات علمية وعملية تدعم استدامة الريادة الإماراتية في الاقتصاد الإسلامي.​